L'un des principaux inconvénients de la tomographie par cohérence optique dans le domaine de Fourier (FDOCT) est la plage de profondeur de mesure limitée. Les techniques de déphasage permettent de reconstruire le signal complexe de l'échantillon, ce qui permet de doubler la plage de profondeur. Dans les réalisations FDOCT complexes actuelles, le déphasage est introduit via une modulation de la longueur du trajet de référence, ce qui entraîne des erreurs de phase chromatique, en particulier si des sources lumineuses à large bande passante sont utilisées. Avec des déphaseurs acousto-optiques dans les bras de référence et d'échantillonnage, et le détecteur étant verrouillé sur la fréquence de battement résultante, le signal est détecté en quadrature à grande vitesse. La fréquence du signal de battement est la même pour toutes les longueurs d'onde, ce qui permet une reconstruction complexe achromatique. Avec un laser Ti:Sapphire à 800nm et une largeur spectrale de 130nm, un système FDOCT complexe hétérodyne est réalisé avec une fréquence de ligne de 20kHz et une résolution axiale de 4µm.
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